GC-MS非靶向代谢组学和转录组学研究方法,2021年11月,上海交通大学医学院附属新华医院冯丽萍教授课题组在Science of the Total Environment期刊发表了题为“Transcriptomics integrated with metabolomics reveals the effect of Bisphenol F (BPF) exposure on intestinal inflflammation ”的研究成果,通过GC-MS非靶向代谢组学和转录组学研究方法,发现了BPF暴露的肠道毒性的特征,探究了可能的发病机理。中文标题:转录组学结合代谢组学揭示了双酚F(BPF)暴露对肠道炎症的影响研究对象:人结肠粘膜上皮细胞系(NCM460)发表期刊:ScienceoftheTotalEnvironment影响因子:7.963发表时间:2021年11月合作单位:上海交通大学附属新华医院运用生物技术:GC-MS非靶向代谢组学(由鹿明生物提供技术支持)、转录组学、qRT-PCR基于LC-MS/GCMS代谢组学从样本采集到数据分析一站式服务。上海蛋白质组学和代谢组学的结合
GC-MS代谢组学结果:通过GC-MS代谢组学观察到 92种化合物,其中,49种与数据库中可用的化合物相匹配,包括重要的发酵代谢物,如葡萄糖、**酸、琥珀酸和几种 (n=10) 初级氨基酸。NMR也观察到了七种已鉴定的化合物。通过 GC-MS 测量,表面(15 厘米)SOM 中的糖和氨基酸浓度随温度处理而变化,随着温度的升高,通常趋向于更高的糖浓度和更低的游离氨基酸浓度(图 3)。谷氨酰胺在氨基酸中是一个明显的例外,在浓度与温度处理中观察到了积极的趋势(图 3)。此外,与植物应激反应相关的化合物(油酸、肌醇、半乳糖醇和 4-羟基-3-甲氧基苯甲酸)随温度升高而增加(SI 附录,图 S5)。浙江代谢组学题库聚焦于代谢产物研究,采用高精尖的分析仪器,对细胞内的代谢物进行定性和定量分析。
GC-MS非靶向代谢组学等研究方法:2021年10月,广东石油化工大学环境科学与工程学院孙建腾教授课题组在《Chemosphere》期刊发表的题为“Metabolomic analysis and oxidative stress response reveals the toxicity in Escherichia coli induced by organophosphate flame retardants tris (2-chloroethyl) phosphate and triphenyl phosphate”的研究成果,通过GC-MS非靶向代谢组学等研究方法,发现包括糖酵解/糖异生、磷酸戊糖代谢、嘌呤代谢、谷胱甘肽代谢、胺素代谢,丙氨酸和天冬氨酸等代谢途径被破坏。大多数差异表达的代谢物被下调,表明有机磷阻燃剂对代谢功能和关键代谢途径有抑制作用。本研究揭示了生物中有机磷阻燃剂对环境产生的风险提供了新的见解。
粪便LC-MS代谢组学研究方法,2022年,复旦大学上海市第五人民医院创伤急危重症医学科唐建国教授课题组在FrontiersinCellularandInfectionMicrobiology期刊发表的题为“DiallylDisulfide(DADS)AmelioratesIntestinalCandidaalbicansInfectionbyModulatingtheGutmicrobiotaandMetabolitesandProvidingIntestinalProtectioninMice”的研究成果,通过粪便微生物16SrRNA测序和粪便LC-MS代谢组学研究方法,发现了DADS***减轻了DSS诱导下肠道白色念珠菌***,并改变了小鼠肠道微生物群落结构和代谢特征,探究了DADS可以调节肠道微生物群和代谢物并保护肠道屏障的内在机理,为***白色念珠菌***提供了理论依据。代谢组学——寻找代谢物与生理病理变化的相对关系研究方式。
GC-MS代谢组学和 LC-MS代谢组学研究:盐度的变化会影响甲壳类动物的生长、***和疾病状态。文章作者通过非靶代谢组学对青蟹适应盐度急性下降过程中的代谢变化进行了研究,利用GC-MS和LC-MS数据联合分析了青蟹应对盐度急性下降情况的主要代谢途径。研究结果表明,在急性低盐胁迫下,青蟹通过甘油磷脂代谢物调节生物膜的结构发生变化,然后通过ABCs转运蛋白运输氨基酸和碳水化合物,实现细胞内外的渗透平衡。此项研究体现了组学技术在机制研究中的重要作用。王春琳课题组深耕青蟹研究,近些年来探索青蟹对环境的适应变化也在各大期刊上发表:项目文章|iTRAQ蛋白组学助力宁波大学越冬期间拟穴青蟹代谢变化研究项目文章|两篇背靠背,王春琳、王欢课题组揭示拟穴青蟹适应盐度骤降的代谢机理代谢组学 生物标志物挖掘**-欧易生物。北京非靶代谢组学
代谢组学方案改变科学的组学研究方案,即刻咨询!。上海蛋白质组学和代谢组学的结合
顶空GC-MS代谢组学,中文标题:利用BADH2新等位基因生产芳香三系杂交稻研究对象:水稻发表期刊:PlantBiotechnologyJournal影响因子:9.803发表时间:2021.08.31发表单位:中国水稻研究所运用生物技术:GC-MS顶空代谢组学(由鹿明生物提供技术支持)、基因编辑技术香味是决定稻米烹饪和食用特性的独特和关键指标之一。2021年8月,中国水稻研究所胡培松院士团队在PlantBiotechnologyJournal期刊发表的研究成果,依靠GC-MS顶空代谢组学的平台对BADH2等位基因系成熟籽粒进行性状分析。研究新型BADH2等位基因生产芳香杂交水稻机理,加快了水稻品种香味研究改良进程。鹿明生物顶空GC-MS代谢组学测定技术还可用于茶叶、花卉以及各种农产品中酚类、酯类、醇类等挥发类代谢物使挥发性物质成分检测。上海蛋白质组学和代谢组学的结合
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